- marginnote能从一本书链接到另一本书吗？
- marginnote能从多本书中搜索并建立关系图吗？
技术框架都有现成的，图数据库有（应该只用到很小一部分的功能），自动化的布局（记录用户的拖拽位置也算自动化的一种）也有，需要的是集成在一起的能力。
手动布局的一个问题就是：如果我想要某个子集该怎么布局呢？最简单的就是搜索的时候。
还涉及到新增内容的时候，所以，最后总是会走到自动化的布局，但是自动化的布局和做笔记的初衷相悖。
windows上相似的软件叫 BookxNote
都可以，本来就是这么用的
bookxnote我用过，整体流畅度和功能性不如marginnote，优点是免费。marginnote除了需要付费外，做了很多细致和深入的设计，但没有win平台，作者也表示暂时不会有win
可以试一下 org-brain
数据可视化用表格，notion就是这么做的。
楼主的问题是笔记的可视化，数据只是笔记的一部分。
感谢推荐。我曾经用MarginNote，但是后来放弃了，转成PDF Expert+org-noter+org-noter-plus。MarginNote阅读和笔记的深度融合让人印象深刻，放弃的原因：
- 本质是给book进行 margin note的工具，体验过它的编辑、检索、管理等功能，并不适合作为通用笔记的管理工具。
- PDF进了MN后很难把笔记导出，读完后的文件管理不能进行统一化。
我更希望，每一个卡片是对应到一个org-mode的heading：这个heading可以是链接到某本书，也可以是org-capture创建的独立于书的笔记。我觉得可视化是组织管理的一个手段，但是编辑、检索等功能对笔记管理也很关键。
这个无限的白板用什么呢？用web好像不是很容易做到呀！
org-super-link 它可以建立 Heading 和 Heading 之间的联系。
是我的话，就用JavaScript的 canvas2D 呀
如果你是个大老板想要做一个这样的产品，那我就接你这项目 
顺便调戏/挑战一下 XMind
你可以做个雏形，最基本的功能就两个：
- 一个大白板，可以缩放
- 白板上放上mardkown渲染的html，可以缩放，可以处理用户事件
就可以开源了
图数据库什么的还好说，我更擅长后端。主要是前端也就触过html、css等最基础的，对canvas等就不太熟。像这样的工具适合用canvas还是svg呢？我本来想找一个脑图或是流程图的项目学习一下，但是发现大家现有的方法基本都只能给节点或形状设置label，没有大段带格式的文字的情况。简单查阅了下，似乎无论是svg还是canvas，大段文字似乎都比较麻烦？也没看到在它们里面渲染大段markdown的例子。所以不太确定是不是技术框架本身的局限？现成的图框架，可以支持建立节点之间的关系，但是不能在节点中渲染大段文字；html渲染markdown等比较方便，但是我不确定它能拖拽、建立元素之间的关系么？我现在的情况是，因为对前端实现不熟，所以技术选型完全无从下手。
关于布局的话，对于我的使用场景，第一原则肯定是要手动布局的。如果是发现、探索关联，自动化布局就行。但是我主要是希望把它作为辅助思考的媒介和思考结果的展示，每次打开元素的位置都发生变化肯定不合适，因为元素的位置也包含了一定的含义，比如同级的元素是对齐的，父级元素在它们上方。我觉得更合适的方式是在新增多个笔记的时候自动化布局避免碰撞，或者可以手动选中多个元素，进行布局，类似draw.io:
大白板就是 canvas, 缩放就是尽量把画出来的生成一个图片放上去（就像缓存），可以很快，保存好每个文件所在的坐标，以计算用户鼠标对应哪个文件？
初始思路，好像不复杂，估计已经有很多了（不过我享受闭门造车的过程）
感谢推荐。org-brain我之前用过，与org-roam相比，它能自定义笔记之间的关系，而不是直接从引用关系中抽取，但是没有可视化啊。org-super-link也主要是方便建立双链，但是我的述求主要是可视化 
不是大老板 ，只是在自己工作、学习过程，很多时候需要对多条笔记进行综合，分析它们之间的关系，看看是否可以抽出统一的模型等，现在笔记呈现方式多多少少成为生产力的瓶颈了。
不过你的回复感觉是个好思路诶，是说把笔记（org-mode或markdown）渲染成图片，放在canvas上么？那么渲染成的这个图片的文本可以选中么？笔记之间可以交互么？
另外，如果已经有很多了，能不能介绍一下，或是介绍一下怎么找到这些资源么？
Graphviz dot可以试一试
感谢推荐，不过GDL不是这个需求的合适解，我希望能可视化、交互地调整笔记间的关系。