严格来讲，不是多文件的形式，而是无层次的组织结构，有利于记录无序的思维和单次有限的知识吸收。在一个目录中的许多无层次的文件和在一个文件的许多无层次的大纲，本质都是无层次的组织结构。这就是为什么我说「把所有笔记作为heading放在一个org文件也是一样的」。
因此，个人之见，多而小文件和 少而大文件 在知识管理角度来看没有本质区别。关键是目前功能的实现是应用在什么对象。比如说，以我所知，列视图只能用于大纲，无法用于文件。roam的backlink是应用于文件（诚如 @VagrantJoker 所说，roam支持了标题的引用，但是它会在该文件的标题2的反向链接中，展示链接到该文件标题1的条目，因此很明显，基本单位是文件，具体实例）
我也很推荐在大纲之外，建立笔记之间更多的关联。毕竟联想是理解掌握、乃至迁移运用的关键。从无到有当然是进步，但是随着笔记数量的增长，新的问题会出现：
（来自我坛某友，欢迎告知来源）
因为backlink只是反映了「引用」这一种关系，笔记之间的关系是很多的：影响、相反、相似等等（更多讨论参见此处），因此在backlink和tag的联系之上，我觉得还需要额外的结构，说明具体是怎样的关系（fine-grained labeled associations）。
目前这种实现方式基于ID，所以从粒度来讲，依然是大纲，没有变得更细。所以想知道与直接的ID链接到大纲相比，它扩展了哪些应用场景？