如图。不仅限于 M-x，find-file 和 swiper 等等也有类似的现象。minibuffer 里会有一段空白，*Messages* 里也没有历史记录。
我的配置是 Centaur Emacs，自己修改了一些，但没有涉及到 UI 的部分。
你可能无意中开启了 toggle-debug-on-quit 或者在终端运行过 pkill -SIGUSR2 -i emacs 命令。
再执行一次 M-x toggle-debug-on-quit 即可关闭。
minibuffer中的空白是ivy-posframe作者故意而为之，主要是为了遮挡minibuffer的重复输出。不喜欢可以设置 ivy-posframe-hide-minibuffer为nil。
首先感谢大家的回复。
我发现这个问题的起因是 sis 的 sis-global-respect-mode，关闭之后就没有复现了，不是 ivy 的问题。
至于 sis 的问题，我再去学习一下。