Org-ref integration with Skim.app [Update: 双向跳转]

et2010 · 2018 年5 月 14 日 13:54

这个链接里也有一套工作流：

http://tech.memoryimprintstudio.com/pdf-annotation-related-tools/#org0ed959e

fuxialexander · 2018 年5 月 14 日 13:56

666这个也不错

et2010 · 2018 年5 月 14 日 14:13

我的提取方法，基于 Org-noter:

https://github.com/et2010/org-noter/tree/work

et2010 · 2018 年5 月 15 日 07:58

虽然我现在还不能双向跳转，但是用起来已经非常爽了。

现在对我来说梦想中的功能就是在 pdf-tools 中可以用矩形框标注图片，然后用 org-noter 提取 annotation 的时候可以自动把图片以及位置提取出来。如果能办到的话简直就是科研神器了。以后作笔记什么的只用 emacs + pdf-tools + org-noter 最多再配上 zotero 就够了。

但是只能是个梦想，~~不知道为什么 pdf-tools 的作者很干脆地回绝了图片标注的 featrue request。~~

没有回绝，但是也没有在开发，矩形框标注也没有

pdf-tools 的 server 是 c 写的，hack 不动啊，哪位大神给指指路，有可能办到吗？

fuxialexander · 2018 年5 月 15 日 09:36

看了下有 pdf-tools/pdf-view.el at master · politza/pdf-tools · GitHub 这个function？只是没有画矩形注释的功能？那样的话其实新建一个普通文本注释占位置也可以吧

et2010 · 2018 年5 月 15 日 12:16

见我的帖子里提出的一种办法

pdf-tools 提取图片标注 Emacs-general

我想到一个主意，就是高亮图标题，图标题上一般都有编号。这样提取高亮文字后如果识别是图标题的话，就插入对应编号的图片。图片可以事先通过 bash 命令提取： pdfimages -all yourdoc.pdf ./fig 这样会在当前文件夹内生成 fig-000.jpg fig-001.jpg fig-002.jpg ... 等图片文件。这样如果提取的图标题是 Fig 1. Blah Blah Blah 那么可以用 elisp 代码判断是图标题，进而插入对应的图片 fig-000.jpg 待解决的问题，有些段落开头就是图编号（比如 Fig 1 shows，如果这类文字被高亮，则可能会和图标题混淆，导致在不该插入图片的地方插入图片。这个方法对于期刊论文一般没有问题，如果是学位论文，图标题一般带有章节编号，比如 Fig 2.1，而提取的图片仍然按照顺序编号，这样就没法根据图标题中的编号找到对应的图片了。这个应该怎么解决呢？有些 PDF 中可能会带有一些和正文无关的图片，比如 logo 什么的。用 pdfimages 命令会把这些多余的图片也提取出来，并导致…

fuxialexander · 2019 年8 月 2 日 15:03

我刚发现pdftools是有图片提取的功能的。。只不过没有矩形框标注

先用鼠标框出想截图的范围（按住拖拽，和微信截图一样，但是没有实时显示的矩形框，不过中间的文字会被选中）

然后运行pdf-view-extract-region-image这个函数图片就会出现在一个新的buffer中

其实可以hack一个新的函数先高亮标注选中区域内的文字，然后把截图保存在指定文件夹，名称包含bibtex-key或pdf文件名，页码甚至即将创建的org heading的ID等信息，然后将这些信息同时也保留在highlight note和org property里

这样也能实现双向跳转

xiaolaoc · 2019 年8 月 3 日 01:48

问下,可以用pdf-expert代替skim从而实现双向跳转吗

hek14 · 2019 年8 月 3 日 01:58

看过实现。能支持applescript的阅读器都可以，没有提供接口的不行

xiaolaoc · 2019 年8 月 3 日 08:07

可以分享一下链接吗

xiangsheng · 2019 年8 月 3 日 09:22

linux下面在pdf文档上做笔记用什么方法比较好？

fuxialexander · 2019 年8 月 3 日 12:21

问就是在做了

xiaolaoc · 2019 年8 月 4 日 06:18

大神给力啊,期待你的结果

fuxialexander · 2019 年8 月 4 日 06:55

啊。。突然发现你说的是pdf-expert不是pdf-tools。。。pdf-expert我上次看到的时候还是不行的。。没有提供需要的applescript接口。。

xiaolaoc · 2019 年8 月 4 日 07:06

主要是pdf-expert可以多开pdf文件然后标签式管理,skim每次都单独打开一个窗口,切换起来不太方便.pdf-tools还没用过,期待大神完成后录一个教程,看看效果

hek14 · 2019 年8 月 4 日 07:12

PDF-tools之前显示不太清晰，不支持Retina显示的效果

fuxialexander · 2019 年8 月 4 日 07:18

是的 PDF-tools在mac上体验一般 linux VM里还是不错的支持4K display

似乎pdf-tools已经加入对retina/hiDPI的支持

github.com

politza/pdf-tools/blob/db7de3901ae0e55f6ab8cf9baec257f706c3d16e/lisp/pdf-view.el#L940


      
            ;; TODO: add DATA and PROPS to docstring.
            "Like `create-image', but with set DATA-P and TYPE arguments."
            (declare (indent 1) (debug t))
            (let ((image-data (make-symbol "data")))
              `(let ((,image-data ,data))
                 (apply #'create-image ,image-data (pdf-view-image-type) t ,@props
                        (cl-list*
                         :relief (or pdf-view-image-relief 0)
                         (when (and (eq (framep-on-display) 'mac)
                                    (= (pdf-util-frame-scale-factor) 2))
                           (list :data-2x ,image-data)))))))
          
          
(defun pdf-view-create-page (page &optional window)
            "Create an image of PAGE for display on WINDOW."
            (let* ((size (pdf-view-desired-image-size page window))
                   (data (pdf-cache-renderpage
                          page (car size)
                          (if (not (pdf-view-use-scaling-p))
                              (car size)
                            (* 2 (car size)))))
                   (hotspots (pdf-view-apply-hotspot-functions

fuxialexander · 2019 年8 月 4 日 07:31

skim也支持打开文件为tab的

在系统设置-dock里将“Prefer tabs when opening documents”设为Always即可

hek14 · 2019 年8 月 4 日 07:35

值得看一看，我也觉得两个APP之间切换终究还是麻烦了一些。假如PDF-tools做的可以了我会转过去

fuxialexander · 2019 年8 月 4 日 07:38

嗯嗯全用PDFtools的好处在于可以在全GUI平台实现双向跳转而且notes信息可以真的保留在PDF文档本身里而非像skim那样是独立的一个annotation文件