不确定是否跟MacBook芯片有关，我本地的macOS（Intel x86）和Windows上测试都没有问题。
你还可以再尝试下：
emacs -Q 重现。(setq centaur-prettify-org-symbols-alist nil)。org-modern。init-org.el.toggle-debug-on-error, C-g看backtrace（如果起作用）。二分法排除下，建议关掉corfu-mode试试
Centaur Emacs是不是开启了什么自动格式化的功能或插件啊，有时候上下移动光标缩进都会改变，这个改变一般都不正确，而我甚至不能修正这些错误，就比如这个图里面的:family和:height
很明显缩进不正确，但是我不管怎么换行、删除然后重新输入等等，都不能让它们对齐，甚至连elisp-mode的C-M-\都不行，然而我运行emacs -Q后使用C-M-\是可以正确格式化的 emacs是在wsl里面安装的，配置文件是全新安装的，我没有修改任何配置，custom.el安装完第一次打开就是不对齐的，这个问题在msys2里面安装的emacs也可以复现用GUI是什么效果？根据提示，问题描述清楚些才好定位。跟特殊环境相关的恕我无能为力
自动控制缩进的插件大概率是aggresive indent？可以试着先关闭这个插件
然后这里的错位可能和制表符有关系，换成空格应该更好些，可以设置 (setq-default indent-tabs-mode nil)
试试往这两个方向排查吧
gui和terminal下的都试过，上面最开始发的图片都是VcXsrv下测试的，而且我用msys2安装的windows原生emacs也有这个问题，别的emacs发行版都正常，晚上有空我可以开虚拟机测试
问题是这样的，同一个文件在Centaur Emacs和其他编辑器包括其他Emacs发行版下显示的缩进不同，就像前面截图显示的，缩进正确的文件在Centaur Emacs中显示不正确，而且当进行某些操作，比如查询函数文档、查询字典或者换行等操作，缩进会发生变化，但是没有显示文件已被修改，使用Vanilla Emacs或者别的编辑器打开这个文件，缩进仍然是正确的，这个问题在wsl的emacs和msys2的emacs中均可复现，且在gui和terminal下均可复现，同时更改字体无效，另外与emacs具体版本应该无关，因为使用相同的字体和环境，仅更改配置文件为Doom Emacs或者其他emacs发行版就可以正确显示，楼上所说关闭插件和更改indent-tabs-mode均无效
晚上装了个Manjaro的虚拟机，一样有这种问题，刚打开custom.el什么都不做的时候是对齐的，然后只是移动了一下光标，就变成了这样
然后我就运行了C-h v随便查看了一个变量，按q退出后就变成了这样
Centaur 不会自动改缩进，你的买哦数更像是贯标移动后没刷新。你可以尝试
(remove-hook 'emacs-lisp-mode-hook (lambda () (setq-local lisp-indent-function #'my-lisp-indent-function)))确实感觉是某种刷新问题，但是所有的emacs版本我都试过了，全都有这个问题，msys2安装的emacs就是原生emacs，我还测试了wsl2的emacs和全新安装的manjaro虚拟机的emacs，无一例外都有这个问题，各种字体也都试过了，包括带nerd和不带的，甚至terminal下的都尝试过，全都一样的，添加这个代码也没有任何区别，问题看起来并不是缩进的问题，而是显示的问题，因为缩进实际上并没有改变，但是显示的缩进是错误的，而且我也测试过，只有Centaur Emacs的配置有这个问题，无配置的Emacs还是诸如Doom Emacs的配置在各种系统的emacs中都显示正常，只能猜测是Centaur Emacs中的某些设置或者插件导致了这种问题，我在全新安装的虚拟机都能重现，应该是系统无关的，但是因为没有错误提示，我没办法知道是什么导致的
今天又测试了一下，是highlight-indent-guides-mode的问题，在各种系统的emacs版本中，只要关闭了这个mode，所有的缩进都会正常显示，而且C-M-\的格式化也能正常进行，上下移动光标产生的缩进异常等都解决了，我尝试修改了init-highlight.el中关于highlight-indent-guides的代码，发现只要highlight-indent-guides-method的值不是character，就不会产生各种缩进问题，接着我修改了highlight-indent-guides-character为?|，同样可以正常显示，甚至我换了一个跟默认值相似的?\xFFE8也是正常的，看其来是默认的值?\x2502存在某些问题
跟机器上安装的字体相关，unicode字符显示不一样
应该是跟某些字体设置有关，因为Windows、wsl和Manjaro的系统字体是完全不同的，然而都会出现这种问题，我尝试注释了Centaur Emacs中关于symbol、emoji和cjk字体相关的代码，同时也尝试了回退到使用all-the-icon而非nerd-icon的Centaur Emacs版本，问题都没有解决，然而奇怪的是设置使用相同字体的Doom Emacs添加indent-guides模块后也能正常显示，既然相同的字体Doom Emacs能正常显示没道理Centaur Emacs不能
注释了Centaur Emacs中所有字体设置的代码，问题仍然存在，然而看了一下Doom Emacs中doom-font的定义，和Centaur Emacs似乎没什么区别，尝试替换了highlight-indent-guides-character的值，发现似乎非Halfwidth的unicode符号都不能正常显示。然后我对比了一下Doom Emacs和Centaur Emacs中的一些差异，发现当minibuffer中有命令时，字符的高度似乎不同，这是Doom Emacs里面的
这是Centaur Emacs里面的
可以看到图中y和n的高度是不同的，这是否是导致两者行为不同的原因呢？