[讨论]你的emacs文献/知识管理方案是什么?

我也想把 zotero 替换掉全用 ebib,但是 zotero 的 connector 和 better bibtex 确实好用,所以我的想法是看能不能把 zotero 当作后端处理 PDF。

通过jabref管理一下就好了啊。谷歌镜像搜索bib,然后把pdf链接进去。

对于有doi的直接拉org-ref中。

请问这个高级选项在哪里配置的,我的菜单里找不到哦。

macOS 上是 zotero->preferences(⌘-,)->Better BibTeX->advanced

zotero那个connector自动抓取,然后zotfile自动重命名后退送到同步盘,通过better bibtex导出到emacs里面感觉太舒服了。另外ebib听说过,但没有使用过,有什么特别的是zotero以及org-ref不能做到的而必须用到ebib吗?想学习一下

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org-ref 和ebib都可以管理bib文件,这两个相比有什么优劣呐?

这些都是 ebib 没法很方便做到的😂️。

昨天研究了下 ebib 导入一个文献可能要分为两步,找到 bibtex ebib-import,然后 ebib-import-file/ebib-download-url 插入文献。当然 arxiv 还有什么的 wiki 中有方法可以一键导入。现阶段 zotero 导出再用 ebib 的话删除文献又需要回到 zotero 就有点割裂。

喜欢 ebib 在于其可以很好的与 Org mode 结合(reading list 和笔记什么的),把文献管理也放到 Emacs 中完成就很爽(用 zotero 鼠标点来点去还是不是很喜欢)。

就我短暂使用两个的体验来说,org-ref 可能还是更偏向引用?

ebib 会有个界面,如果我想找一篇文献的笔记或者其他操作可以随时打开 ebib 进行操作,org-ref 是不是要先插入到 org-mode 文件中然后再进行操作(之后还要删除)?

另外之前用 org-ref 打开对应文件或者笔记偶尔会出问题,需要打开对应 bib 文件一次。

update: 仔细看了下 org-ref 和 helm-bibex 的文档,发现其实除了没有一个 ebib 界面能做的更多些

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org-ref可以管理bib文件,查找文献可以用helm-bibex/ivy-bibex

最近发现了 annotated bibliography 这个想法,直接用org mode配合org-ref管理文献、笔记和相关链接。好处是可以非常方便的对文献分类,并建立文献间的联系。具体地,就是利用org links在emacs里实现一个纯文本的文献知识和笔记浏览器。如果不想折腾ebib,这样的管理方法可能还更直观。

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对于没有doi的org-ref提供了crossref-lookup he crossref-add-bibtex-entry, 从crossref.org上拉取结果, 个人体验crossref.org拉取的bib内容是比谷歌学术还翔实,就是网速太慢老是拉取失败。。。

除此之外org-ref还有能从arxiv等不少网站上拉取bib的函数,缺点都是网速有时候不好使

试了一下 crossref.org, 数据还是缺。比如 NIPS 的论文都搜不到

确实,我刚刚试了一下,org-ref提供的获取bib的utility基本上都是面向自然科学期刊之类的,可能是org-ref作者本身就是搞化学的原因吧

主要还是我这方向会议论文居多,会议时效性强,又不像期刊那么规整

不太明白,为什么你要保留pdf的原文件名。

请问这个名字有什么特殊吗?(我发现原文件名往往很短,并且非常不可读。。。)

John Kitchin做的是机器学习在计算化学上的应用,以及一些非均相催化的计算。这个方向的工作的发表形式是以期刊为主,很少有会议论文。

防止重复下载同个文件

原始pdf名可能会重的。。。

比如:很多人的博士论文都命名为 thesis.pdf

我又不会去特地保存別人没正式发出来的论文。这种我一般马上读完就删了。

正式发在 homepage 的下載下来都是这样的

保下名字以后哪些是散装的哪些是同个地方批量下的一眼就能分出来。最主要实在没心情给百来个文件一个个改名字,只改一部分算咋回事。

除了thesis.pdf之外,我发现有的pdf还会被命名成tr1.pdf,tr2.pdf,tr3.pdf,tr4.pdf 之类的,虽然我不清楚这些命名的含义。

我刚才试用了一下Mendeley,发现这个软件是支持按规则批量改名的(以前我都是手动改 :rofl:).

但是我还是发现一些缺点:

  1. Mendeley的批量改名似乎只支持Author,Title,Year等的组合。但有时候,我们往往需要在文件名上手动增加一些自己的评论。这个功能还是要回到文件管理里进行操作。

  2. Mendeley 如果要在文件名里保持 Author的话,它会把所有作者全部放进来(考虑一下windows路径长度限制)

  3. Mendeley的导入似乎不支持保持原始文件夹的结构?因为我的pdf已经被我按目录分类好了,Mendeley似乎并不会继承?(也可能是我不会用)

看来有必要学习一下Mendeley了。。。

另外,你们说的联网自动下载pdf是什么意思?

你们看pdf文献都是通过软件自动下载的吗?

比如 1:打开一个pdf拖到最后的References页面,如果你想看其中的一个文献,有没有办法直接获取呢?我每次都是在谷歌上搜索的。。。

比如 2:你可以在Mendeley里导入一个bib,但是Mendeley并不会通过这个bib帮你下载对应pdf

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